上海日本研究交流中心成立于2009年12月，是由上海市编制办批准、上海市财政全额拨款，隶属于上海市人民对外友好协会的事业单位。
中心宗旨是以中日关系为主线，对涉及两国政治、经济、外交、社会、文化等领域的问题进行自主研究与委托研究，提出对日工作的综合政策建议；组织、参与中日之间民间友好交流活动，促进两国民间相互理解，推动两国民间友好往来。
主要业务为从事和扶植日本问题研究，开展中日友好交流活动，业务范围主要是日本问题的研究、交流和咨询服务等，包括：
l 组织对涉日问题的调查和研究；
l 开展多种形式的学术交流活动；
l 为上海市人民政府领导层的相关决策提供咨询服务；
l 为上海与日本各界开展互利互惠的友好交往拓展渠道；
l 接受有关部门和企事业单位的委托，进行课题研究、专业培训，并向社会开放提供有关涉外特别是日本问题的专题咨询和服务。
中心现有人员11名，与上海市及全国对日研究权威机构均有密切的合作关系。
中心设立学术委员会，作为学术研究与活动的指导机构，中心学术委员会共有成员26人，包括上海及全国对日研究著名专家学者，全面开展涉日政治、经济、外交、社会、文化等领域的研究和交流。
中心定期举行学术研讨会，邀请上海市及全国日本问题研究学者、日本相关领域专家，围绕中日之间的焦点、难点、热点问题开展学术研讨；协调组织各类学术交流活动；组织有志从事对日研究的青年学者、学生举办沙龙；开展中日民间文化交流，参与举办各类民间友好活动，促进中日文化互鉴，加深了解和友谊。
